В июле 1921 г. на ул. Советской (ныне ул. Дувановская) для посещения был открыт «Музей старины».
В 1925 г. музей был реорганизован в Музей Краеведения, в котором действовало 5 отделов: караимский, татарско-ногайский, археологический, курортно-бальнеологический и производственный.
Значительный ущерб нанесла музею фашистская оккупации Евпатории, но уже в мае 1944 г. музей возобновил работу. В 1947 г. определилась структура музея - работало три отдела: дореволюционного прошлого, истории советского общества и природы.
В 1968 г. для расширения экспозиционной площади и создания отдела дореволюционного прошлого музею были переданы здания караимских кенас. В тот же год в них была открыта экспозиция отдела, а в 1974 г. – зал археологии.
В 1988 г. в специально построенном зале была открыта диорама «Высадка евпаторийского десанта 5 января 1942 года», созданная заслуженным художником РСФСР Б. Таутиевым, (Студия военных художников имени М. Грекова, г. Москва)
В 1989 г. музей первым в Крыму открыл этнографическую экспозицию.
В 2000 г. на улице Дувановской напротив центрального входа в музей под стеклянным пирамидальным куполом был создан археологический комплекс «Северо-западный пригород античного города Керкинитиды (V-III вв. до н.э.)». Рядом с раскопом под открытым небом была открыта лапидарная выставка.
В 2012 г. на ул. Революции был открыт музей истории Крымской войны -отдел военной истории Евпаторийского краеведческого музея.
22 декабря 2014 г. Евпаторийский краеведческий музей прошел перерегистрацию по российскому законодательству, и с 2015 г. является муниципальным бюджетным учреждением культуры «Евпаторийский краеведческий музей»
Режим работы экспозиции
Евпаторийский краеведческий музей (ул. Дувановская, 11) – 10-00 – 17-00, выходные дни – среда, суббота, проводятся экскурсии
Музей истории Крымской войны (ул.Революции, 61) – 10-00 – 17-00, выходные дни – среда, суббота, проводятся экскурсии
Диорама «Высадка Евпаторийского десанта 5 января 1942 года» (размещается в здании краеведческого музея по ул.Дувановской, 11)
